Dôležitým ukazovateľom kvality rekuperačného výmenníka je jeho účinnosť. Hodnota účinnosti výmenníka sa reálne pohybuje u vetracích jednotiek pre rodinné domy v intervale 80 až 95 %. U väčších vetracích jednotiek, určených pre komerčné, resp. priemyselné budovy, je účinnosť výmenníka nižšia.